Итак, наличие нескольких типов связей (структурных, генетических, связей взаимодействия и субординации), единой направленности функционирования элементов, подсистем и системы в целом, а также устойчивость, самоуправление и саморазвитие системы модульного обучения характеризуют ее как органичное целое.
Органичность предлагаемой системы модульного обучения, ее способность к самоорганизации, самообучению и саморазвитию обеспечивают большие адаптивные возможности этой системы при сохранении развивающей функции в качестве ведущей. Поэтому органичная система модульного обучения позволит создать наиболее благоприятные условия для развития каждого ребенка с учетом интересов личности и общества.